Deel 1

Daisuke Ido woont in Kuzutetsu, de afvalstad onder het onbereikbare Zalem. In het puin dat Zalem in Kuzutetsu stort, vindt hij een intact gebleven cyborg die hij de naam Alita geeft. Alita heeft haar geheugen verloren en weet dus niet wie ze is en waarvoor ze ontworpen is. Als ze mee op pad gaat met Ido, die een Hunter Warrior is (premiejager), ontdekt ze dat ze de Pantzer Kunst perfect beheerst, wat erop wijst dat ze ontworpen is voor het gevecht. Na een lange zoektocht met onder meer een dienstperiode onder bewind van Zalem komt Alita's geheugen beetje bij beetje terug. Spijtig voor haar moet ze daarvoor haar geliefden opgeven om te kunnen overleven in de wrede wereld van Zalem. Wat maakt ons menselijk en wat niet? Doorheen de zoektocht van de cyborg Alita naar haar indentiteit, probeert Yukito Hishiro een antwoord te vinden op deze vraag. Een groots moment van de science fiction.